Apesar do lançamento da versão beta das ferramentas oficiais de modding para S.T.A.L.K.E.R. 2: Heart of Chornobyl, os jogadores estão sendo aconselhados a evitar temporariamente certas modificações. A GSC Game World publicou uma lista de complementos que estão atualmente incompatíveis com o Patch 1.5.
Juntamente com as notas do patch, o estúdio emitiu um aviso separado para os usuários de mods. De acordo com o aviso, complementos personalizados instalados na pasta "~mods", assim como várias ferramentas não oficiais, podem fazer o jogo travar. Estes incluem:
Após o Patch 1.5, os jogadores também são fortemente desencorajados a usar arquivos .ini editados anteriormente, aplicar ajustes de otimização através de software de terceiros ou habilitar o console do jogo e ferramentas de depuração. Em caso de problemas técnicos, os desenvolvedores recomendam desativar todos os mods completamente.
Logo após a última atualização, um dos desenvolvedores por trás de S.T.A.L.K.E.R. 2 lançou uma série de mods divertidos, adicionando personagens como CJ de GTA: San Andreas, Shrek e Thomas, o Trem. Enquanto isso, os jogadores descobriram que o kit de ferramentas de modding oficial pesa mais de 600 GB. Detalhes principais do Patch 1.5 podem ser encontrados aqui.