No início do desenvolvimento, a história de The Witcher 3: Wild Hunt foi reescrita várias vezes, deixando a CD Projekt RED com uma série de rascunhos não utilizados. Acontece que em um dos finais originais, Geralt poderia ter embarcado em uma missão que lembrava Mass Effect 2.
Os desenvolvedores disseram ao PC Gamer que se inspiraram diretamente no RPG de ficção científica da BioWare. Como resultado, uma versão inicial do final de The Witcher 3 era mais sombria e envolveria o jogador montando uma equipe para uma missão final contra a Caçada Selvagem — onde alguns companheiros acabariam sendo sacrificados.
Era em um drakkar de Skellige que você navegava em um mar congelado, e você deveria lutar contra a Caçada Selvagem nesse drakkar. Nós redesenhamos um pouco, e decidimos tornar esse final mais pessoal.
A CDPR também lembrou de algumas missões cortadas. Por exemplo, na expansão Blood and Wine , havia uma vez uma missão inspirada em A Knight's Tale, na qual um tratador chamado Egg vestia a armadura de um cavaleiro que havia morrido de um ataque cardíaco e partia para caçar um monstro. No entanto, sendo inexperiente, ele gradualmente jogaria fora pedaços da pesada armadura durante a jornada, acabando apenas com uma espada. Mesmo que o jogador o salvasse, o tratador acabaria sendo morto por aldeões enfurecidos que o pegaram roubando a armadura.
Curiosamente, em um ponto, Blood and Wine estava sendo desenvolvido sem nenhum vampiro. A equipe tinha ideias que não incluíam Regis ou Dettlaff, embora apenas por um curto período. A versão de Marcin Blacha dessa história nunca foi totalmente revelada.
Anteriormente, a CDPR também compartilhou um rascunho inicial da história de The Witcher 3 em que Geralt se juntou à Caçada Selvagem.